A coleção do Centro de Referência Cultural do Estado (Ceres), sob a guarda do MIS, é resultado da pesquisa que realizou um inventário do patrimônio imaterial do Estado do Ceará entre as décadas de 1970 e 1990. Ela é constituída por registros em áudio, cromos, fotografias e cordéis. O projeto contou com a participação de diversos pesquisadores e produziu um rico acervo sobre os saberes e fazeres ligados à cultura tradicional popular. Sua atuação deu-se no contexto da criação do Centro Nacional de Referência Cultural (CNRC), fundado em 1975, que tinha como intuito referenciar elementos formadores da cultura e identidade brasileiras, com pesquisas voltadas para as mais diversas matrizes culturais.
A experiência do Ceres contribuiu para a formação de pesquisadores e intelectuais cearenses das mais diversas áreas, como Oswald Barroso, Maurício Albano, José Carlos Matos, Olga Paiva, Norma Colares, Roberto Aurélio Lustosa da Costa, Rosemberg Cariry, Otávio Menezes, Sylvia Porto Alegre, Gilmar de Carvalho. A diversidade de olhares dos pesquisadores advindos das mais diversas áreas (ciências sociais, história, filosofia, música, teatro, fotografia e artes plásticas), possibilitou que as atividades do projeto, inicialmente focadas somente no artesanato, se expandissem para a documentação e pesquisa de outras manifestações culturais, como a literatura de cordel e diversas festas e folguedos populares. Ao serem incorporadas ao MIS, as atividades realizadas pelo Ceres nortearam muitas das ações realizadas pelo museu, o qual manteve projetos não apenas no intuito de registrar tais processos e manifestações, mas de tornar-se espaço de referência nos âmbitos da cultura e da pesquisa.
